ЭСУДО - Электронная система учёта динамики опыления у орхидных

Помощь

Введение:
Электронная система учёта данных по динамике опыления у орхидных (ЭСУДО) разработана с целью автоматизации обработки информации в области антэкологии орхидных и повышения контроля за её качеством. В основу методики учёта данных был положен принцип раздельной регистрации изменений, которые производили насекомые в двух половинках пыльника и рыльца. ЭСУДО разработана на основе современных компьютерных и интернет технологий (Apache, CGI/Perl, JavaScript, HTML, CSS) и постоянно доступна в интернете по следующему адресу - http://www.r-b-o.eu/ESUDO/
В настоящее время в ЭСУДО имеются следующие функции: Формуляр ввода первичных данных: назад к оглавлению
Формат учётной записи. Предназначен для ввода первичных данных наблюдений за динамикой цветения и опыления. Данные должны вводится в формате CSV (coma sapareted value), где в качестве разделителя используется знак точки с запятой( ; ). Ниже приведен пример учётной записи одноразового наблюдения за отдельным растением в популяции

N1[12];1-f;2-2/0;3-2/2;4-s;5-2/0;6-b;7-b;8-b;9-b;10-b;11-b;12-d;

На первом месте в учётной записи должен бить указан порядковый номер растения ( N1 ). Номер растения должен иметь уникальное значение в пределах отдельной популяции, т.к. он имеет идентификационное значение при обработке данных в ЭСУДО. За идентификационным номером растения в квадратных скобках( [12] ) должно стоять число генеративных метамеров (бутонов, цветков или плодов) на соцветии.
Далее перечисляются состояния всех генеративных метамеров на соцветии. Учётная запись по отдельному метамеру состоит из 2 частей: идентификационного номера генеративного метамера, который является уникальным в пределах отдельного соцветия и состояния, в котором находится генеративный метамер на данный момент.Для обозначения состояния генеративных метамеров в системе используются следующие буквенные обозначения: f-плод, b-бутон, s-самоопыление, d-уничтожен/разрушен (например 1-f;4-s;7-b;12-d).
Для обозначения цветков используется цифровая символика, которая позволяет производить дифференцированный учёт состоянии репродуктивных органов (гнезд пыльников и рыльца) на момент исследования. Состояния гнезд пыльников и рыльца стоят после идентификационного номера и должны быть разделены между собой косой чертой (например 2-2/0;3-2/2). При этом на первом месте указывается состояние пыльника, а на втором - состояние рыльца. Состояния репродуктивных органов могут принимать значения от 0 до 2. Значение "0" присваивается репродуктивным органам цветка, состояние которых не было изменено с момента распускания цветка. Для пыльника состояние "0" означает, что оба гемиполлинария находятся в гнездах. Для рыльца состояние "0" означает, что обе половинки рыльца свободны от пыльцы/пыльцевых массул (Рис. 1). При удалении одного гемиполлинария из гнезда пыльнику присваивается значение "1". При обнаружении пыльцы на одной из лопастей рыльца последнее получает значение "1". У цветка со значением "2/2" соответственно удалены оба гемиполлинария из гнезд и на обоих половинах рыльца имеется пыльца. Сочетание всех возможных состояний пыльника и рыльца дает 9 возможных комбинаций (Рис. 1).




Рис. 1. Возможные состояния генеративных органов цветка у орхидных. 2/0 - оба гемиполлинария находятся в гнездах пыльника, обе половинки рыльца свободны от пыльцы/массул; 2/1 - оба гемиполлинария находятся в гнездах пыльника, на одной половинке рыльца нанесена пыльца/массулы; 2/2 - оба гемиполлинария находятся в гнездах пыльника, на обоих половинках рыльца нанесена пыльца/массулы; 1/0 - один гемиполлинарий извлечен из гнезда пыльника, обе половинки рыльца свободны от пыльцы/массул; 1/1 - один гемиполлинарий извлечен из гнезда пыльника, на одной половинке рыльца нанесена пыльца/массулы; 1/2 - один гемиполлинарий извлечен из гнезда пыльника, на обоих половинках рыльца нанесена пыльца/массулы; 0/0 - оба гемиполлинария извлечены из гнезд пыльника, обе половинки рыльца свободны от пыльцы/массул; 0/1 - оба гемиполлинария извлечены из гнезд пыльника, на одной половинке рыльца нанесена пыльца/массулы; 0/2 - оба гемиполлинария извлечены из гнезд пыльника, на обоих половинках рыльца нанесена пыльца/массулы.

Последовательность одинаковых состояний генеративных метамеров может вводится в систему в более простой форме при помощи замены значка "-" на "->". В этом случае ЭСУДО автоматически дополнит ряд недостающими элементами. Дополнение проиходит до указанного порядкового номера генеративного метамера после стрелки("->"). Если после стрелки отсутствует номер метамера, то развертывание учетной записи происходит до максимально разрешенного для этого растения числа метамеров. Ниже приведены примеры свёрнутых и развернутых вариантов записей для одного и тогоже растения:
N1[12];1->b;
N1[12];1-b;2-b;3-b;4-b;5-b;6-b;7-b;8-b;9-b;10-b;11-b;12-b;

N1[12];1->b;4->2/1;7-2/0;9->b;12-d
N1[12];1-b;2-b;3-b;4-2/1;5-2/1;6-2/1;7-2/0;9-b;10-b;11-b;12-d;

Создание новой учётной записи (назад к оглавлению). Для создания новой однодневной учётной записи необходимо нажать кнопку "добавить новый день" и написать в окошке "Имя файла для нового дня" имя нового файла в формате: Род-вид_место расположения_имя популации_год_месяц_день. При этом год, месяц и день долгны записываться в формате ГГГГ_ММ_ДД(YYYY_MM_DD). После чего необходимо нажать кнопку "запомнить". При этом в окошке веб-проводника произойдет разделение поля имени на 4 части. Занесение первичных данных в поле "учетная запись" формуляра возможно как по-строчно, так и целым блоком при соблюдении указанного выше формата для учётной записи. ЭСУДО осуществляет проверку правильности написания имени нового файла по следующим категориям: наличие имени файла в системе, правильность формата написания имени файла и законность использования значков в имени файла. При одном из перечисленных выше ошибок система выдает соответствующее стандартное сообщение об ошибке:
  • error 007 - файл с этим именем уже существует!
  • error 008 - не правильний формат имени файла!
  • error 009 - использование в имени файла запрещенных символов!
Проверка вводимых данных (назад к оглавлению). При отклонении от разрешенного формата учетной записи ЭСУДО выдает сообщение об ошибке без сохранения в памяти компьютера ошибочной записи. В настоящем система способна распознавать следующие ошибки в формате учётной записи:
  • error 001 - нарушена уникальность идентификационного номера растения в популяции!
  • error 002 - плохой формат учётной записи!
  • error 003 - данные о состоянии цветков отсутствуют
  • error 004 - использованы неразрешенные символы. В записи разрешены только следующие символы: N,-,->,f,b,s,d,0,1,2,/
  • error 005 - число задекларированных цветков в квадратных скобках меньше числа цветков в учётной записи
  • error 006 - ошибка в имени файла. Данные не могут быть запомнены!
Анализ динамики цветения и опыления в популяции: назад к оглавлению
VVV.